مدرسه علمیه حضرت مهدی ( عجّ ) از سال ۸۲ فعالیت خود را با مدیریت حجه الاسلام و المسلمین نظافت یزدی در طبقه فوقانی مسجد فقیه سبزواری واقع در خیابان طلاب مشهد مقدس با نام مدرسه علمیه صاحب الزمان عج با پذیرش حدود ۲۰ طلبه در مقطع دیپلم آغاز نمود. با گذشت سه سال و با ظهور توفیقات مدرسه به پیشنهاد و دعوت حضرت حجه الاسلام امامی، موسس و مدیر وقت مدرسه علمیه حضرت مهدی (ع) به مکان کنونی در خیابان المهدی ۱۹ نقل مکان کرد. به فضل پروردگار و عنایات حضرت ولی عصر ( عجّ ) در مسیر تربیت طلاب فاضل ، کارآمد ، دردمند و انقلابی تاکنون از توفیقات خوبی برخوردار شده است . مدرسه حضرت مهدی (عج) در فضایی به وسعت ۸۰۰ متر مربع بنا شده بود که با افزایش طلاب و نیاز به گسترش فضای فیزیکی هم اکنون با خریداری و افزودن دو منزل همجوار زمین مدرسه به حدودا ۱۳۰۰ متر مربع در حدود ۲۵۰۰ متر مربع زیر بنا می¬باشد و پذیرای بیش از ۱۰۰ طلبه از مقطع دیپلم در سطح ۱ است.